厦门市南平商会是南平市在厦门从事工商业的单位和个人及关心厦南两地经济发展的厦门市企业家、学者和有关人士自愿组成的非盈利性民间组织团体。在南平、厦门两地市委、市政府的关心和支持下，在南平市工商联、厦门市民政局、厦门市经发局的领导下，厦门市南平商会于2007年1月20日召开了第一次会员大会及第一届理事会，并正式宣布成立。
2011年3月27日，商会召开第二届会员代表大会，产生理事58名，其中，设会长1名，常务副会长9名，副会长16名，均通过民主选举产生，并报有关部门审核。自成立以来，商会拥有会员企业300家以上，有圣达威服饰、百拓生物工程、世纪年轮（厦门）投资、蓝天碧海环境工程、宏鼎投资、欧米科贸、中卫阳光雕塑、新时光娱乐等著名的集团和公司。行业遍及IT、房地产开发、酒店、环保材料、电子、网络科技、软件、机械、建材、食品、医药、文化传播、广告、物流、国内外贸易等方面，为厦门经济建设和发展发挥了积极的作用。
商会建立了完整规范的管理体系和科学的组织构架，制定了章程和各项管理制度。商会下设办公室，配备专职工作人员，设立了会长、秘书长日常工作制度，并建立了商会的网站和刊物，与会员企业之间进行广泛交流和联系。
近年来，商会为会员企业相互沟通、信息交流、共谋发展搭建有效平台，为会员企业在资金、权益维护、管理培训、行业咨询、商务交流、政府关系协调等多方面提供帮助，以此引导会员企业积极参加国家和地方的经济建设，商会章会长等多位会员单位在家乡南平积极参与了重大项目的投资。同时，商会积极投身家乡的公益事业，特别是2010年，“6.18”特大水灾给南平市造成极大的破坏，商会立即组织会员召开紧急会议，捐物捐款，慷慨解囊，共捐助财物达200多万元。
商会本着“同心同德、共谋发展”的宗旨，始终把维护会员企业的合法权益作为基本的责任和义务，把服务会员企业作为商会工作的重中之重。近年来，商会各负责人走访近百家会员企业，了解企业困难，实实在在地帮助会员企业排忧解难。同时，帮助企业论证项目，寻求合作伙伴，搭建企业与政府直接对话的平台，促进会员企业的健康发展。
商会凝聚南平籍商界精英，整合厦门、南平两地资源，为繁荣发展厦门和南平经济发挥积极作用。这是一个交流联络、分享资源的平台，更是一个培养人才的摇篮。商会会员企业家秉承南平文化的精髓，谦恭做人、认真做事、艰苦创业，用他们的艰辛和汗水，智慧和胆识，打造诚信，成功创出骄人的业绩，共同谱写振兴南平、厦门两地经济的新篇章。